Transformando el paradigma de Fitopatógeno a Fitopatobioma: Nuevos conceptos a la luz del metamicrobioma de los quelites.
Responsable: Dra. Angélica Ruiz Font. IPN.
Participantes:
Edgar Hernández Hernández, Diana Urbano Manzano, Claudia Francisco Morales, Grecia
Robles Bueno, Victor Hugo Cruz Galindo, Ulises Vergara Rico, Milagros Rojas Anselmo,
Alfredo Hernández Juarez, Karina Enriquez Guillén, Rafael Pérez Estrada, Leslie González
Celis y Margarita Calitl Flores.
La milpa es un policultivo y cosecha múltiple, no solo es cultivo de maíz sino de frijol, calabacitas, chile y plantas asociadas (arvenses, quelites). Es la clave para el aprovechamiento sostenible de la Biodiversidad Mexicana, es el soporte de la seguridad alimentaria. La milpa en México es sin duda el campo de cultivo donde se han mantenido, protegido, cultivado y domesticado la mayoría de las especies que denominan especies de uso tradicional subvaloradas y subutilizadas para fines prácticos: los quelites.
El quelite proviene de la palabra “Quihuitl”, que significa planta tierna comestible, son plantas silvestres que se encuentran en la milpa, usados desde tiempos prehispánicos. Las comunidades mantienen una relación con estas plantas, aprovechándolas en diferentes aplicaciones: alimento, medicina, forraje animal, festividades o actividades.
Objetivos Generales:
Aportar los elementos para el desarrollo de una plataforma de ECOLOGÍA VEGETAL DE ARVENSES, en cuanto a botánica, ecología de poblaciones, trabajo de muestreo en campo, uso de programas para realizar los cálculos estadísticos del proyecto (Past, Excel).
Analizar la base de datos del microbioma de especies ruderales comestibles (quelites) desde un enfoque novedoso relacionado con los microorganismos fitopatógenos y no patógenos.
Objetivos Secundarios:
- Desarrollar las herramientas informáticas necesarias para establecer una tubería de análisis metagenómico para ser aplicado en el análisis de nuevas hipótesis y predicciones sobre el fitobioma y el origen de fitopatógenos.
- Desarrollar una plataforma de biología sintética que permita conjuntar herramientas informáticas de aplicación en estudios de metagenómica en la comprobación de hipótesis y predicciones.
- Conjuntar estudiantes y profesores interesados en bioinformática a través de cursos de especialidad para proyectos de análisis de secuencias relacionadas con fitopatógenos.
- Generar una base de herramientas bioinformáticas que permiten analizar bases de datos preexistentes con seleccionar genes de interés en aplicación en nuevo conocimiento.
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Dra. Angélica Ruiz Font.
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